Bioinformática

Servicios

Resecuenciación Genómica:

  • Análisis de datos de DNA-Seq (Exomas, Genomas Completos y Secuenciación Personalizada)
  • Detección de variantes genómicas y estructurales
  • Anotación, filtrado y estudio de asociación de variantes

RNA-Seq:

  • Alineamiento de lecturas y cuantificación de la expresión de los genes/transcritos
  • Análisis de datos de expresión RNA-Seq (Estudios de expresión diferencial, supervivencia, series temporales, clustering, co-expresión, predicción, selección de marcadores, etc.)

Sequenciación De Novo:

  • Ensamblaje de genomas
  • Identificación y anotación funcional de genes
  • Estudios de genómica comparativa (búsqueda de genes/clusters/funciones diferenciales, definición de pangenomas, comparación entre cepas, identificación de variantes, etc.)

Epigenómica:

  • Análisis de datos de ChIP-Seq y Methyl-Seq
  • Identificación y estudio de regiones reguladoras de la transcripción
  • Identificación y comparación de patrones de metilación

Microarrays:

  • Análisis de datos de microarrays de expresión y ADN de las plataformas Affymetrix, Illumina y Agilent
  • Estudios de expresión diferencial, supervivencia, series temporales, clustering, co-expresión, predicción, selección de marcadores, etc.

Paneles de proteínas:

  • Control de calidad y normalización de los datos
  • Análisis de datos (diferencia de cantidad de proteína, correlación con variante fenotípica, etc.)

Análisis funcionales de genes/proteínas:

  • Estudio de enriquecimiento funcional de listas de genes/proteínas
  • Inferencia y estudio de sistemas biológicos

Desarrollo de aplicaciones bioinformáticas:

  • Programación de métodos y algoritmos de análisis de datos
  • Creación de Webs dinámicas para la distribución de métodos y resultados científicos

Almacenamiento de datos de investigación:

  • Servicio de almacenamiento de datos de investigación
  • Diseño, implementación y administración de bases de datos (p.ej. de pacientes, muestras, etc.)

Formación:

  • Organización e impartición de cursos
  • Actividades de formación individualizada

La unidad de bioinformática está continuamente ampliando su oferta de servicios. Estos servicios se desarrollan mediante nuestra participación en proyectos de investigación. Contacte con nosotros si tiene alguna colaboración que sugerirnos.

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